生物显微镜的价格大概在每台几千元，便宜的有一两千元。配置高的2-3万，不同类别的生物显微镜，价格也不尽相同。就类别而言，

1.按照定位级别分类。可以分为学生生物显微镜、实验级生物显微镜、研究级生物显微镜。

2. 按照目镜的个数分类。可以分为单目生物显微镜、双目生物显微镜、三目生物显微镜。视频生物显微镜，单筒生物显微镜

3. 按目镜和移动台的相对位置分类。可以分为正置生物显微镜和倒置生物显微镜。正置(常规)生物显微镜的物镜在移动台的上方，倒置生物显微镜的物镜在移动台的下方。

4. 按成像原理分类。可以分为光学生物显微镜和电子生物显微镜。光学显微镜主要由目镜、物镜、载物台和反光镜(集光镜)组成。目镜和物镜都是凸透镜，焦距不同。物镜的凸透镜焦距小于目镜的凸透镜的焦距。物镜相当于投影仪的镜头，物体通过物镜成倒立、放大的实像。目镜相当于普通的放大镜，该实像又通过目镜成正立、放大的虚像。经显微镜到人眼的物体都成倒立放大的虚像。电子显微镜是根据电子光学原理，用电子束和电子透镜代替光束和光学透镜，使物质的细微结构在非常高的放大倍数下成像。由于电子束的波长远远小于可见光的波长，所以即使电子束的锥角仅为光学显微镜的1%，电子显微镜的分辨本领仍远远优于光学显微镜。光学显微镜的很大放大倍率约为2000倍，而现代电子显微镜很大放大倍率已经超过了300万倍。